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Gene | ![]() ![]() |
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Name: | yafC ![]() |
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Synonym(s): | ECK0208, EG11649, b0208 | |
Genome position(nucleotides): | 229967 <-- 230881 | |
Strand: | reverse | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
49.62 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0000694 | |
ECHOBASE: |
EB1602 | |
ECOLIHUB: |
yafC | |
OU-MICROARRAY: |
b0208 | |
STRING: |
511145.b0208 | |
COLOMBOS: | yafC |
Product | ![]() ![]() |
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Name: | DNA-binding transcriptional regulator YafC | ||||||||||||||||||||
Synonym(s): | YafC, predicted DNA-binding transcriptional regulator LYSR-type | ||||||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||||||
Cellular location: | cytosol | ||||||||||||||||||||
Molecular weight: | 33.776 | ||||||||||||||||||||
Isoelectric point: | 7.497 | ||||||||||||||||||||
Motif(s): | |||||||||||||||||||||
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Classification: |
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Note(s): | Note(s): ...[more]. | ||||||||||||||||||||
Evidence: | [COMP-HINF-FN-FROM-SEQ] Human inference of function from sequence [EXP-IPI] Inferred from physical interaction |
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Reference(s): |
[1] Gao Y., et al., 2018 [2] Perez-Rueda E., et al., 2004 |
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External database links: | |||||||||||||||||||||
ALPHAFOLD: |
P30864 | ||||||||||||||||||||
DIP: |
DIP-11210N | ||||||||||||||||||||
ECOCYC: |
EG11649-MONOMER | ||||||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b0208 | ||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR036388 | ||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR036390 | ||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR005119 | ||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR000847 | ||||||||||||||||||||
MODBASE: |
P30864 | ||||||||||||||||||||
PFAM: |
PF03466 | ||||||||||||||||||||
PFAM: |
PF00126 | ||||||||||||||||||||
PRIDE: |
P30864 | ||||||||||||||||||||
PRINTS: |
PR00039 | ||||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS50931 | ||||||||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_414744 | ||||||||||||||||||||
SMR: |
P30864 | ||||||||||||||||||||
UNIPROT: |
P30864 | ||||||||||||||||||||
Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
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Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
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promoter | TSS_421 | 228928 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [3] | ||
promoter | TSS_422 | 230910 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [3] | ||
promoter | TSS_423 | 230912 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [3] | ||
promoter | TSS_424 | 230918 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [3] | ||
promoter | yafCp6 | 231083 | reverse | nd | [COMP-AINF] | [4] | ||
promoter | TSS_425 | 231274 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [3] | ||
promoter | TSS_426 | 231276 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [3] | ||
promoter | TSS_427 | 231280 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [3] | ||
promoter | TSS_428 | 231299 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [3] |
Reference(s) |
![]() |
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