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Gene | ![]() ![]() |
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Name: | acnB ![]() |
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Synonym(s): | ECK0117, EG12316, b0118, yacI, yacJ | |
Genome position(nucleotides): | 131615 --> 134212 | |
Strand: | forward | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
55.89 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0000411 | |
CGSC: |
36955 | |
ECHOBASE: |
EB2222 | |
ECOLIHUB: |
acnB | |
OU-MICROARRAY: |
b0118 | |
STRING: |
511145.b0118 | |
COLOMBOS: | acnB |
Product | ![]() ![]() |
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Name: | AcnB | ||||||||||||||||||||||||
Synonym(s): | YacI, YacJ | ||||||||||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||||||||||
Cellular location: | cytosol | ||||||||||||||||||||||||
Molecular weight: | 93.498 | ||||||||||||||||||||||||
Isoelectric point: | 5.041 | ||||||||||||||||||||||||
Motif(s): |
![]() |
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Classification: |
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Note(s): | Note(s): ...[more]. | ||||||||||||||||||||||||
Reference(s): |
[1] Calderon IL., et al., 2009 [2] Kim CW., et al., 2007 [3] Maciag M., et al., 2012 [4] Stefanopoulou M., et al., 2011 |
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External database links: | |||||||||||||||||||||||||
ALPHAFOLD: |
P36683 | ||||||||||||||||||||||||
DIP: |
DIP-9044N | ||||||||||||||||||||||||
ECOCYC: |
ACONITATEDEHYDRB-MONOMER | ||||||||||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b0118 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR036008 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR036288 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR018136 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR015933 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR015932 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR015931 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR015929 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR015928 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR004406 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR001030 | ||||||||||||||||||||||||
MODBASE: |
P36683 | ||||||||||||||||||||||||
PANTHER: |
PTHR43160:SF1 | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
1L5J | ||||||||||||||||||||||||
PFAM: |
PF11791 | ||||||||||||||||||||||||
PFAM: |
PF00330 | ||||||||||||||||||||||||
PFAM: |
PF06434 | ||||||||||||||||||||||||
PRIDE: |
P36683 | ||||||||||||||||||||||||
PRODB: |
PRO_000022043 | ||||||||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS00450 | ||||||||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS01244 | ||||||||||||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_414660 | ||||||||||||||||||||||||
SMR: |
P36683 | ||||||||||||||||||||||||
UNIPROT: |
P36683 | ||||||||||||||||||||||||
RNA cis-regulatory element | ![]() |
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Attenuation: | Transcriptional |
Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
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Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
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promoter | TSS_254 | 130229 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [5] | ||
promoter | yacHp3 | 131307 | reverse | nd | [COMP-AINF] | [6] | ||
promoter | yacHp5 | 131466 | reverse | nd | [COMP-AINF] | [6] | ||
promoter | TSS_255 | 131743 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [5] | ||
promoter | TSS_256 | 132124 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [5] | ||
promoter | TSS_257 | 132840 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [5] | ||
promoter | TSS_258 | 133449 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [5] | ||
promoter | TSS_259 | 133468 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [5] |
Reference(s) |
![]() |
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