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Gene | ![]() ![]() |
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Name: | acnB ![]() |
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Synonym(s): | ECK0117, EG12316, b0118, yacI, yacJ | |
Genome position(nucleotides): | 131615 --> 134212 Genome Browser | |
Strand: | forward | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
55.89 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0000411 | |
CGSC: |
36955 | |
ECHOBASE: |
EB2222 | |
ECOLIHUB: |
acnB | |
OU-MICROARRAY: |
b0118 | |
STRING: |
511145.b0118 | |
COLOMBOS: | acnB |
Product | ![]() ![]() |
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Name: | AcnB | ||||||||||||||||||
Synonym(s): | YacI, YacJ | ||||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||||
Cellular location: | cytosol | ||||||||||||||||||
Molecular weight: | 93.498 | ||||||||||||||||||
Isoelectric point: | 5.041 | ||||||||||||||||||
Motif(s): |
![]() |
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Classification: |
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Note(s): | Note(s): ...[more]. | ||||||||||||||||||
Reference(s): |
[1] Calderon IL., et al., 2009 [2] Kim CW., et al., 2007 [3] Maciag M., et al., 2012 [4] Stefanopoulou M., et al., 2011 |
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External database links: | |||||||||||||||||||
DIP: |
DIP-9044N | ||||||||||||||||||
ECOCYC: |
ACONITATEDEHYDRB-MONOMER | ||||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b0118 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR036008 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR036288 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR018136 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR015933 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR015932 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR015931 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR015929 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR015928 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR004406 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR001030 | ||||||||||||||||||
MODBASE: |
P36683 | ||||||||||||||||||
PANTHER: |
PTHR43160:SF1 | ||||||||||||||||||
PDB: |
1L5J | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF06434 | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF00330 | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF11791 | ||||||||||||||||||
PRIDE: |
P36683 | ||||||||||||||||||
PRODB: |
PRO_000022043 | ||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS01244 | ||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS00450 | ||||||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_414660 | ||||||||||||||||||
SMR: |
P36683 | ||||||||||||||||||
UNIPROT: |
P36683 | ||||||||||||||||||
RNA cis-regulatory element | ![]() |
---|---|
Attenuation: | Transcriptional |
Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
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Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
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promoter | TSS_254 | 130229 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [5] | ||
promoter | yacHp3 | 131307 | reverse | nd | [ICWHO] | [6] | ||
promoter | yacHp5 | 131466 | reverse | nd | [ICWHO] | [6] | ||
promoter | TSS_255 | 131743 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [5] | ||
promoter | TSS_256 | 132124 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [5] | ||
promoter | TSS_257 | 132840 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [5] | ||
promoter | TSS_258 | 133449 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [5] | ||
promoter | TSS_259 | 133468 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [5] |
Reference(s) |
![]() |
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