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Gene | ![]() ![]() |
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Name: | ygdG ![]() |
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Synonym(s): | ECK2793, EG12372, b2798, exo, xni | |
Genome position(nucleotides): | 2931055 --> 2931810 | |
Strand: | forward | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
52.78 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0009174 | |
ECHOBASE: |
EB2275 | |
ECOLIHUB: |
ygdG | |
OU-MICROARRAY: |
b2798 | |
STRING: |
511145.b2798 | |
COLOMBOS: | ygdG |
Product | ![]() ![]() |
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Name: | flap endonuclease | ||||||||||||||||||||
Synonym(s): | Exo, ExoIX, Xni, YgdG | ||||||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||||||
Cellular location: | cytosol | ||||||||||||||||||||
Molecular weight: | 28.166 | ||||||||||||||||||||
Isoelectric point: | 6.678 | ||||||||||||||||||||
Motif(s): | |||||||||||||||||||||
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Classification: | |||||||||||||||||||||
Note(s): | Note(s): ...[more]. | ||||||||||||||||||||
Evidence: | [EXP-IDA] Inferred from direct assay | ||||||||||||||||||||
Reference(s): |
[1] Anstey-Gilbert CS., et al., 2013 [2] Sayers JR. 1994 |
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External database links: | |||||||||||||||||||||
ALPHAFOLD: |
P38506 | ||||||||||||||||||||
DIP: |
DIP-11145N | ||||||||||||||||||||
ECOCYC: |
EG12372-MONOMER | ||||||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b2798 | ||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR036279 | ||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR029060 | ||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR020046 | ||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR020045 | ||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR008918 | ||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR002421 | ||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR038969 | ||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR022895 | ||||||||||||||||||||
MODBASE: |
P38506 | ||||||||||||||||||||
PANTHER: |
PTHR42646 | ||||||||||||||||||||
PDB: |
3ZDE | ||||||||||||||||||||
PDB: |
3ZDD | ||||||||||||||||||||
PDB: |
3ZDC | ||||||||||||||||||||
PDB: |
3ZDB | ||||||||||||||||||||
PDB: |
3ZDA | ||||||||||||||||||||
PDB: |
3ZD8 | ||||||||||||||||||||
PDB: |
3ZD9 | ||||||||||||||||||||
PFAM: |
PF02739 | ||||||||||||||||||||
PFAM: |
PF01367 | ||||||||||||||||||||
PRIDE: |
P38506 | ||||||||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_417278 | ||||||||||||||||||||
SMART: |
SM00475 | ||||||||||||||||||||
SMART: |
SM00279 | ||||||||||||||||||||
SMR: |
P38506 | ||||||||||||||||||||
UNIPROT: |
P38506 | ||||||||||||||||||||
Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
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Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
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promoter | ygdGp2 | 2930873 | forward | nd | [COMP-AINF] | [3] | ||
promoter | TSS_3115 | 2931034 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [4] |
Reference(s) |
![]() |
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