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Gene | ![]() ![]() |
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Name: | rlmN ![]() |
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Synonym(s): | ECK2513, EG12401, b2517, yfgB | |
Genome position(nucleotides): | 2643129 <-- 2644283 | |
Strand: | reverse | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
52.99 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0008287 | |
ECHOBASE: |
EB2301 | |
ECOLIHUB: |
rlmN | |
OU-MICROARRAY: |
b2517 | |
STRING: |
511145.b2517 | |
COLOMBOS: | rlmN |
Product | ![]() ![]() |
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Name: | 23S rRNA m2A2503 methyltransferase/tRNA m2A37 methyltransferase | ||||||||||||||||||||||||
Synonym(s): | RlmN, YfgB, ribosomal RNA large subunit methyltransferase N | ||||||||||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||||||||||
Cellular location: | cytosol | ||||||||||||||||||||||||
Molecular weight: | 43.086 | ||||||||||||||||||||||||
Isoelectric point: | 6.985 | ||||||||||||||||||||||||
Motif(s): |
![]() |
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Classification: |
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Note(s): | Note(s): ...[more]. | ||||||||||||||||||||||||
Reference(s): |
[1] Atkinson GC., et al., 2013 [2] Hussain S. 2019 [3] Lanz ND., et al., 2012 [4] Stojkovic V., et al., 2015 [5] Stojkovic V., et al., 2021 [6] Zhao C., et al., 2017 |
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External database links: | |||||||||||||||||||||||||
ALPHAFOLD: |
P36979 | ||||||||||||||||||||||||
DIP: |
DIP-12035N | ||||||||||||||||||||||||
ECOCYC: |
EG12401-MONOMER | ||||||||||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b2517 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR013785 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR007197 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR004383 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR040072 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR027492 | ||||||||||||||||||||||||
MODBASE: |
P36979 | ||||||||||||||||||||||||
PANTHER: |
PTHR30544 | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
3RF9 | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
3RFA | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
5HR7 | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
5HR6 | ||||||||||||||||||||||||
PFAM: |
PF04055 | ||||||||||||||||||||||||
PRIDE: |
P36979 | ||||||||||||||||||||||||
PRODB: |
PRO_000023774 | ||||||||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS51918 | ||||||||||||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_417012 | ||||||||||||||||||||||||
SMR: |
P36979 | ||||||||||||||||||||||||
UNIPROT: |
P36979 | ||||||||||||||||||||||||
RNA cis-regulatory element | ![]() |
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Attenuation: | Translational |
Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
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Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
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promoter | ispGp1 | 2641880 | reverse | nd | [COMP-AINF] | [7] | ||
promoter | TSS_2810 | 2641922 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [8] | ||
promoter | TSS_2811 (cluster) | 2641929 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [8] | ||
promoter | TSS_2812 | 2641933 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [8] | ||
promoter | ispGp4 | 2641950 | reverse | nd | [COMP-AINF] | [7] | ||
promoter | ispGp5 | 2641954 | reverse | nd | [COMP-AINF] | [7] | ||
promoter | TSS_2813 (cluster) | 2641985 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [8] | ||
promoter | TSS_2814 (cluster) | 2641990 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [8] | ||
promoter | TSS_2815 | 2641997 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [8] | ||
promoter | TSS_2816 | 2642045 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [8] | ||
promoter | rodZp1 | 2642932 | reverse | nd | [COMP-AINF] | [7] | ||
promoter | rodZp2 | 2642934 | reverse | nd | [COMP-AINF] | [7] | ||
promoter | TSS_2817 | 2644379 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [8] |
Reference(s) |
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