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Gene | ![]() ![]() |
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Name: | ldcC ![]() |
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Synonym(s): | ECK0185, G6094, b0186, ldc, ldcH | |
Genome position(nucleotides): | 209679 --> 211820 | |
Strand: | forward | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
50.89 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0000633 | |
ECHOBASE: |
EB3010 | |
ECOLIHUB: |
ldcC | |
OU-MICROARRAY: |
b0186 | |
STRING: |
511145.b0186 | |
COLOMBOS: | ldcC |
Product | ![]() ![]() |
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Name: | lysine decarboxylase 2 | ||||||||||||||||||||||||
Synonym(s): | Ldc, LdcC, LdcH, lysine decarboxylase, constitutive | ||||||||||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||||||||||
Cellular location: | cytosol | ||||||||||||||||||||||||
Molecular weight: | 80.59 | ||||||||||||||||||||||||
Isoelectric point: | 5.308 | ||||||||||||||||||||||||
Motif(s): |
![]() |
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Classification: |
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Note(s): | Note(s): ...[more]. | ||||||||||||||||||||||||
Reference(s): | [1] Negrete A., et al., 2015 | ||||||||||||||||||||||||
External database links: | |||||||||||||||||||||||||
ALPHAFOLD: |
P52095 | ||||||||||||||||||||||||
DIP: |
DIP-10086N | ||||||||||||||||||||||||
ECOCYC: |
LDC2-MONOMER | ||||||||||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b0186 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR015421 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR015424 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR036633 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR005308 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR000310 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR015422 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR008286 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR011193 | ||||||||||||||||||||||||
MODBASE: |
P52095 | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
5FKZ | ||||||||||||||||||||||||
PFAM: |
PF03711 | ||||||||||||||||||||||||
PFAM: |
PF03709 | ||||||||||||||||||||||||
PFAM: |
PF01276 | ||||||||||||||||||||||||
PRIDE: |
P52095 | ||||||||||||||||||||||||
PRODB: |
PRO_000023075 | ||||||||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS00703 | ||||||||||||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_414728 | ||||||||||||||||||||||||
SMR: |
P52095 | ||||||||||||||||||||||||
UNIPROT: |
P52095 | ||||||||||||||||||||||||
RNA cis-regulatory element | ![]() |
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Attenuation: | Transcriptional |
Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
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Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
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promoter | TSS_388 | 208850 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [2] | ||
promoter | TSS_389 | 209002 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [2] | ||
promoter | TSS_390 | 209273 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [2] | ||
promoter | TSS_391 | 209658 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [2] | ||
promoter | yaeRp3 | 211858 | forward | nd | [COMP-AINF] | [3] |
Reference(s) |
![]() |
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