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Gene | ![]() ![]() |
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Name: | rclR ![]() |
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Synonym(s): | ECK0304, G6175, b0305, ykgD | |
Genome position(nucleotides): | 320227 --> 321081 | |
Strand: | forward | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
51.23 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0001054 | |
ECHOBASE: |
EB3351 | |
ECOLIHUB: |
ykgD | |
OU-MICROARRAY: |
b0305 | |
STRING: |
511145.b0305 | |
COLOMBOS: | rclR |
Product | ![]() ![]() |
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Name: | DNA-binding transcriptional activator RclR | ||||||||||||||||||||||||
Synonym(s): | RclR, YkgD | ||||||||||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||||||||||
Regulator Family: | AraC/XylS | ||||||||||||||||||||||||
Cellular location: | cytosol | ||||||||||||||||||||||||
Molecular weight: | 31.474 | ||||||||||||||||||||||||
Isoelectric point: | 7.293 | ||||||||||||||||||||||||
Motif(s): |
![]() |
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Classification: |
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Note(s): | Note(s): ...[more]. | ||||||||||||||||||||||||
Evidence: | [COMP-HINF-FN-FROM-SEQ] Human inference of function from sequence | ||||||||||||||||||||||||
Reference(s): |
[1] Perez-Rueda E., et al., 2000 [2] Perez-Rueda E., et al., 2004 |
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External database links: | |||||||||||||||||||||||||
ALPHAFOLD: |
P77379 | ||||||||||||||||||||||||
ECOCYC: |
G6175-MONOMER | ||||||||||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b0305 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR011051 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR009057 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR020449 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR032783 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR018060 | ||||||||||||||||||||||||
MODBASE: |
P77379 | ||||||||||||||||||||||||
PFAM: |
PF12833 | ||||||||||||||||||||||||
PFAM: |
PF12852 | ||||||||||||||||||||||||
PRIDE: |
P77379 | ||||||||||||||||||||||||
PRINTS: |
PR00032 | ||||||||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS01124 | ||||||||||||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_414839 | ||||||||||||||||||||||||
SMART: |
SM00342 | ||||||||||||||||||||||||
UNIPROT: |
P77379 | ||||||||||||||||||||||||
Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
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Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
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promoter | TSS_478 | 320033 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [3] | ||
promoter | ykgCp8 | 320088 | reverse | nd | [COMP-AINF] | [4] | ||
promoter | ykgDp3 | 320116 | forward | nd | [COMP-AINF] | [4] | ||
promoter | ykgCp4 | 320170 | reverse | nd | [COMP-AINF] | [4] | ||
promoter | ykgDp2 | 320193 | forward | nd | [COMP-AINF] | [4] | ||
promoter | ykgEp9 | 321481 | forward | nd | [COMP-AINF] | [4] | ||
promoter | ykgEp8 | 321484 | forward | nd | [COMP-AINF] | [4] | ||
promoter | ykgEp7 | 321511 | forward | nd | [COMP-AINF] | [4] | ||
promoter | ykgEp10 | 321537 | forward | nd | [COMP-AINF] | [4] |
Reference(s) |
![]() |
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