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Gene | ![]() ![]() |
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Name: | ybdO ![]() |
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Synonym(s): | ECK0597, G6332, b0603 | |
Genome position(nucleotides): | 636716 <-- 637618 | |
Strand: | reverse | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
38.65 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0002077 | |
ECHOBASE: |
EB3305 | |
ECOLIHUB: |
ybdO | |
OU-MICROARRAY: |
b0603 | |
STRING: |
511145.b0603 | |
COLOMBOS: | ybdO |
Product | ![]() ![]() |
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Name: | putative LysR family DNA-binding transcriptional regulator YbdO | ||||||||||||||||||||
Synonym(s): | YbdO | ||||||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||||||
Cellular location: | cytosol | ||||||||||||||||||||
Molecular weight: | 34.397 | ||||||||||||||||||||
Isoelectric point: | 7.556 | ||||||||||||||||||||
Motif(s): | |||||||||||||||||||||
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Classification: |
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Note(s): | Note(s): ...[more]. | ||||||||||||||||||||
Evidence: | [COMP-AINF-FN-FROM-SEQ] Automated inference of function from sequence | ||||||||||||||||||||
Reference(s): |
[1] Higashi K., et al., 2016 [2] Perez-Rueda E., et al., 2004 |
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External database links: | |||||||||||||||||||||
ALPHAFOLD: |
P77746 | ||||||||||||||||||||
ECOCYC: |
G6332-MONOMER | ||||||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b0603 | ||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR036388 | ||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR036390 | ||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR005119 | ||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR000847 | ||||||||||||||||||||
MODBASE: |
P77746 | ||||||||||||||||||||
PFAM: |
PF03466 | ||||||||||||||||||||
PFAM: |
PF00126 | ||||||||||||||||||||
PRIDE: |
P77746 | ||||||||||||||||||||
PRINTS: |
PR00039 | ||||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS50931 | ||||||||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_415136 | ||||||||||||||||||||
SMR: |
P77746 | ||||||||||||||||||||
UNIPROT: |
P77746 | ||||||||||||||||||||
Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
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Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
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promoter | ybdMp2 | 635555 | reverse | nd | [COMP-AINF] | [3] | ||
promoter | TSS_729 | 637288 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [4] |
Reference(s) |
![]() |
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