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Gene | ![]() ![]() |
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Name: | rimO ![]() |
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Synonym(s): | ECK0825, G6435, b0835, yliG | |
Genome position(nucleotides): | 876710 <-- 878035 Genome Browser | |
Strand: | reverse | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
52.64 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0002843 | |
ECHOBASE: |
EB3251 | |
ECOLIHUB: |
rimO | |
OU-MICROARRAY: |
b0835 | |
STRING: |
511145.b0835 | |
COLOMBOS: | rimO |
Product | ![]() ![]() |
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Name: | ribosomal protein S12 methylthiotransferase RimO | ||||||||||||||||||
Synonym(s): | RimO, YliG | ||||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||||
Cellular location: | cytosol | ||||||||||||||||||
Molecular weight: | 49.582 | ||||||||||||||||||
Isoelectric point: | 5.169 | ||||||||||||||||||
Motif(s): |
![]() |
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Classification: |
|
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Note(s): | Note(s): ...[more]. | ||||||||||||||||||
External database links: | |||||||||||||||||||
DIP: |
DIP-48218N | ||||||||||||||||||
ECOCYC: |
G6435-MONOMER | ||||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b0835 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR041582 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR038135 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR023404 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR020612 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR013848 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR007197 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR006638 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR005840 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR005839 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR002792 | ||||||||||||||||||
MODBASE: |
P0AEI4 | ||||||||||||||||||
PANTHER: |
PTHR43837 | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF00919 | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF04055 | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF18693 | ||||||||||||||||||
PRIDE: |
P0AEI4 | ||||||||||||||||||
PRODB: |
PRO_000023763 | ||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS51918 | ||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS51449 | ||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS50926 | ||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS01278 | ||||||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_415356 | ||||||||||||||||||
SMART: |
SM00729 | ||||||||||||||||||
SMR: |
P0AEI4 | ||||||||||||||||||
UNIPROT: |
P0AEI4 | ||||||||||||||||||
Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
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Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
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promoter | TSS_984 | 878217 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [1] | ||
promoter | bssRp5 | 878246 | forward | nd | [ICWHO] | [2] | ||
promoter | TSS_985 | 878396 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [1] |
Reference(s) |
![]() |
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