![]() ![]() ![]() ![]() ![]() |
Gene | ![]() ![]() |
|
---|---|---|
Name: | ycaN ![]() |
|
Synonym(s): | ECK0891, G6467, b0900 | |
Genome position(nucleotides): | 948660 <-- 949568 Genome Browser | |
Strand: | reverse | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
46.64 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0003060 | |
ECHOBASE: |
EB3462 | |
ECOLIHUB: |
ycaN | |
OU-MICROARRAY: |
b0900 | |
STRING: |
511145.b0900 | |
COLOMBOS: | ycaN |
Product | ![]() ![]() |
||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Name: | putative LysR-type transcriptional regulator YcaN | ||||||||||||||||||
Synonym(s): | YcaN | ||||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||||
Cellular location: | cytosol | ||||||||||||||||||
Molecular weight: | 34.294 | ||||||||||||||||||
Isoelectric point: | 6.517 | ||||||||||||||||||
Motif(s): | |||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||
Classification: |
|
||||||||||||||||||
Note(s): | Note(s): ...[more]. | ||||||||||||||||||
Evidence: | [HIFS] Human inference of function from sequence | ||||||||||||||||||
Reference(s): |
[1] Perez-Rueda E., et al., 2000 [2] Perez-Rueda E., et al., 2004 |
||||||||||||||||||
External database links: | |||||||||||||||||||
ECOCYC: |
G6467-MONOMER | ||||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b0900 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR036388 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR036390 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR005119 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR000847 | ||||||||||||||||||
MODBASE: |
P75836 | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF00126 | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF03466 | ||||||||||||||||||
PRIDE: |
P75836 | ||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS50931 | ||||||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_415420 | ||||||||||||||||||
SMR: |
P75836 | ||||||||||||||||||
UNIPROT: |
P75836 | ||||||||||||||||||
Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
---|
Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
promoter | ycaKp3 | 949547 | forward | nd | [ICWHO] | [3] | ||
promoter | ycaKp4 | 949574 | forward | nd | [ICWHO] | [3] | ||
promoter | ycaKp5 | 949643 | forward | nd | [ICWHO] | [3] |
Reference(s) |
![]() |
---|---|