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Gene | ![]() ![]() |
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Name: | ymdB ![]() |
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Synonym(s): | ECK1031, G6550, b1045 | |
Genome position(nucleotides): | 1105820 --> 1106353 | |
Strand: | forward | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
51.69 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0003549 | |
ECHOBASE: |
EB3633 | |
ECOLIHUB: |
ymdB | |
OU-MICROARRAY: |
b1045 | |
STRING: |
511145.b1045 | |
COLOMBOS: | ymdB |
Product | ![]() ![]() |
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Name: | 2'-O-acetyl-ADP-ribose deacetylase, regulator of RNase III activity | ||||||||||||||||||||||||
Synonym(s): | YmdB | ||||||||||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||||||||||
Cellular location: | cytosol | ||||||||||||||||||||||||
Molecular weight: | 18.88 | ||||||||||||||||||||||||
Isoelectric point: | 5.525 | ||||||||||||||||||||||||
Motif(s): |
![]() |
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Classification: |
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Note(s): | Note(s): ...[more]. | ||||||||||||||||||||||||
External database links: | |||||||||||||||||||||||||
ALPHAFOLD: |
P0A8D6 | ||||||||||||||||||||||||
DIP: |
DIP-48222N | ||||||||||||||||||||||||
ECOCYC: |
G6550-MONOMER | ||||||||||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b1045 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR024900 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR002589 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR043472 | ||||||||||||||||||||||||
MODBASE: |
P0A8D6 | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
1SPV | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
5CMS | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
5CB3 | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
5CB5 | ||||||||||||||||||||||||
PFAM: |
PF01661 | ||||||||||||||||||||||||
PRIDE: |
P0A8D6 | ||||||||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS51154 | ||||||||||||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_415563 | ||||||||||||||||||||||||
SMART: |
SM00506 | ||||||||||||||||||||||||
SMR: |
P0A8D6 | ||||||||||||||||||||||||
UNIPROT: |
P0A8D6 | ||||||||||||||||||||||||
RNA cis-regulatory element | ![]() |
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Attenuation: | Translational |
Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
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Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
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promoter | ymdBp3 | 1105714 | forward | nd | [COMP-AINF] | [1] | ||
promoter | ymdBp4 | 1105738 | forward | nd | [COMP-AINF] | [1] | ||
promoter | TSS_1326 | 1105797 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [2] |
Reference(s) |
![]() |
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