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Gene | ![]() ![]() |
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Name: | pdeG ![]() |
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Synonym(s): | ECK1155, G6608, b1168, ycgG | |
Genome position(nucleotides): | 1217328 --> 1218851 Genome Browser | |
Strand: | forward | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
44.62 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0003918 | |
ECHOBASE: |
EB3647 | |
ECOLIHUB: |
ycgG | |
ECOO157CYC: |
Z1528 | |
ECOO157CYC: |
Z2221 | |
OU-MICROARRAY: |
b1168 | |
STRING: |
511145.b1168 | |
COLOMBOS: | pdeG |
Product | ![]() ![]() |
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Name: | putative c-di-GMP phosphodiesterase PdeG | ||||||||||||||||||
Synonym(s): | PdeG, YcgG | ||||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||||
Cellular location: | periplasmic space,inner membrane,cytosol | ||||||||||||||||||
Molecular weight: | 56.906 | ||||||||||||||||||
Isoelectric point: | 6.985 | ||||||||||||||||||
Motif(s): |
![]() |
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Classification: |
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Note(s): | Note(s): ...[more]. | ||||||||||||||||||
Reference(s): | [1] Sarenko O., et al., 2017 | ||||||||||||||||||
External database links: | |||||||||||||||||||
DIP: |
DIP-11554N | ||||||||||||||||||
ECOCYC: |
G6608-MONOMER | ||||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b1168 | ||||||||||||||||||
ECOO157CYC: |
Z2221-MONOMER | ||||||||||||||||||
ECOO157CYC: |
Z1528-MONOMER | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR001633 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR024744 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR035919 | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF12792 | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF00563 | ||||||||||||||||||
PRIDE: |
P75995 | ||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS50883 | ||||||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_415686 | ||||||||||||||||||
SMART: |
SM00052 | ||||||||||||||||||
SMR: |
P75995 | ||||||||||||||||||
UNIPROT: |
P75995 | ||||||||||||||||||
Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
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Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
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promoter | ycgGp7 | 1217307 | forward | nd | [ICWHO] | [2] | ||
promoter | ymgFp1 | 1218814 | forward | nd | [ICWHO] | [2] | ||
promoter | ymgFp7 | 1218937 | forward | nd | [ICWHO] | [2] | ||
promoter | ymgFp11 | 1218940 | forward | nd | [ICWHO] | [2] | ||
promoter | ymgFp10 | 1218953 | forward | nd | [ICWHO] | [2] |
Reference(s) |
![]() |
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