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Gene | ![]() ![]() |
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Name: | ydcI ![]() |
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Synonym(s): | ECK1416, G6737, b1422 | |
Genome position(nucleotides): | 1494148 <-- 1495071 | |
Strand: | reverse | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
50.54 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0004746 | |
ECHOBASE: |
EB3515 | |
ECOLIHUB: |
ydcI | |
OU-MICROARRAY: |
b1422 | |
STRING: |
511145.b1422 | |
COLOMBOS: | ydcI |
Product | ![]() ![]() |
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Name: | DNA-binding transcriptional dual regulator YdcI | ||||||||||||||||||||
Synonym(s): | YdcI | ||||||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||||||
Cellular location: | cytosol | ||||||||||||||||||||
Molecular weight: | 33.402 | ||||||||||||||||||||
Isoelectric point: | 8.126 | ||||||||||||||||||||
Motif(s): | |||||||||||||||||||||
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Classification: |
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Note(s): | Note(s): ...[more]. | ||||||||||||||||||||
Evidence: | [COMP-HINF-FN-FROM-SEQ] Human inference of function from sequence [EXP-IDA-PURIFIED-PROTEIN-HH] Assay of protein purified to homogeneity from a heterologous host [EXP-IPI] Inferred from physical interaction |
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Reference(s): |
[1] Gao Y., et al., 2018 [2] Perez-Rueda E., et al., 2000 [3] Perez-Rueda E., et al., 2004 [4] Solomon L., et al., 2014 |
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External database links: | |||||||||||||||||||||
ALPHAFOLD: |
P77171 | ||||||||||||||||||||
ECOCYC: |
G6737-MONOMER | ||||||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b1422 | ||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR036388 | ||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR036390 | ||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR005119 | ||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR000847 | ||||||||||||||||||||
MODBASE: |
P77171 | ||||||||||||||||||||
PFAM: |
PF03466 | ||||||||||||||||||||
PFAM: |
PF00126 | ||||||||||||||||||||
PRIDE: |
P77171 | ||||||||||||||||||||
PRINTS: |
PR00039 | ||||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS50931 | ||||||||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_415939 | ||||||||||||||||||||
SMR: |
P77171 | ||||||||||||||||||||
UNIPROT: |
P77171 | ||||||||||||||||||||
Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
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Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
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promoter | ydcIp4 | 1495117 | reverse | nd | [COMP-AINF] | [5] | ||
promoter | ydcJp10 | 1495133 | forward | nd | [COMP-AINF] | [5] | ||
promoter | ydcJp11 | 1495154 | forward | nd | [COMP-AINF] | [5] |
Reference(s) |
![]() |
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