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Gene | ![]() ![]() |
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Name: | dgcF ![]() |
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Synonym(s): | ECK1515, G6808, b1522, yneF | |
Genome position(nucleotides): | 1610907 <-- 1611854 Genome Browser | |
Strand: | reverse | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
50.42 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0005081 | |
ECHOBASE: |
EB3575 | |
ECOLIHUB: |
yneF | |
OU-MICROARRAY: |
b1522 | |
STRING: |
511145.b1522 | |
COLOMBOS: | dgcF |
Product | ![]() ![]() |
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Name: | putative diguanylate cyclase DgcF | ||||||||||||||||||
Synonym(s): | DgcF, YneF | ||||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||||
Cellular location: | inner membrane | ||||||||||||||||||
Molecular weight: | 34.322 | ||||||||||||||||||
Isoelectric point: | 7.775 | ||||||||||||||||||
Motif(s): |
![]() |
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Classification: | |||||||||||||||||||
Note(s): | Note(s): ...[more]. | ||||||||||||||||||
Evidence: | [IMP] Inferred from mutant phenotype | ||||||||||||||||||
Reference(s): |
[1] Sanchez-Torres V., et al., 2011 [2] Steiner S., et al., 2013 |
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External database links: | |||||||||||||||||||
DIP: |
DIP-47997N | ||||||||||||||||||
ECOCYC: |
G6808-MONOMER | ||||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b1522 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR029787 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR000160 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR043128 | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF00990 | ||||||||||||||||||
PRIDE: |
P76147 | ||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS50887 | ||||||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_416039 | ||||||||||||||||||
SMART: |
SM00267 | ||||||||||||||||||
SMR: |
P76147 | ||||||||||||||||||
UNIPROT: |
P76147 | ||||||||||||||||||
Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
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Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
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promoter | uxaBp2 | 1610737 | reverse | nd | [AIPP], [ICWHO] | [3] | ||
promoter | TSS_1837 | 1611861 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [4] | ||
promoter | yneFp7 | 1611874 | reverse | nd | [ICWHO] | [3] | ||
promoter | TSS_1838 | 1611884 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [4] |
Reference(s) |
![]() |
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