![]() ![]() ![]() ![]() ![]() |
Gene | ![]() ![]() |
|
---|---|---|
Name: | kdgR ![]() |
|
Synonym(s): | ECK1826, G7003, b1827, yebP | |
Genome position(nucleotides): | 1909308 <-- 1910099 Genome Browser | |
Strand: | reverse | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
49.75 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0006081 | |
ECHOBASE: |
EB3772 | |
ECOLIHUB: |
kdgR | |
OU-MICROARRAY: |
b1827 | |
STRING: |
511145.b1827 | |
COLOMBOS: | kdgR |
Product | ![]() ![]() |
||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Name: | DNA-binding transcriptional repressor KdgR | ||||||||||||||||||
Synonym(s): | KdgR, YebP | ||||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||||
Regulator Family: | IclR | ||||||||||||||||||
Cellular location: | cytosol | ||||||||||||||||||
Molecular weight: | 30.029 | ||||||||||||||||||
Isoelectric point: | 5.258 | ||||||||||||||||||
Motif(s): | |||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||
Classification: |
|
||||||||||||||||||
Note(s): | Note(s): ...[more]. | ||||||||||||||||||
Evidence: | [IEP] Inferred from expression pattern [IMP] Inferred from mutant phenotype |
||||||||||||||||||
Reference(s): |
[1] Murray EL., et al., 2005 [2] Nishino K., et al., 2001 [3] Pouyssegur J., et al., 1974 |
||||||||||||||||||
External database links: | |||||||||||||||||||
DIP: |
DIP-10057N | ||||||||||||||||||
ECOCYC: |
G7003-MONOMER | ||||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b1827 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR036388 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR036390 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR029016 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR014757 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR011991 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR005471 | ||||||||||||||||||
MODBASE: |
P76268 | ||||||||||||||||||
PDB: |
1YSP | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF09339 | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF01614 | ||||||||||||||||||
PRIDE: |
P76268 | ||||||||||||||||||
PRODB: |
PRO_000023048 | ||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS51078 | ||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS51077 | ||||||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_416341 | ||||||||||||||||||
SMART: |
SM00346 | ||||||||||||||||||
SMR: |
P76268 | ||||||||||||||||||
UNIPROT: |
P76268 | ||||||||||||||||||
Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
---|
Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
promoter | kdgRp8 | 1910125 | reverse | nd | [ICWHO] | [4] | ||
promoter | kdgRp9 | 1910140 | reverse | nd | [ICWHO] | [4] | ||
promoter | yebQp4 | 1910157 | forward | nd | [ICWHO] | [4] | ||
promoter | yebQp5 | 1910159 | forward | nd | [ICWHO] | [4] | ||
promoter | kdgRp1 | 1910253 | reverse | nd | [ICWHO] | [4] |
Reference(s) |
![]() |
---|---|