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Gene | ![]() ![]() |
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Name: | rsmF ![]() |
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Synonym(s): | ECK1834, G7008, b1835, yebU | |
Genome position(nucleotides): | 1920223 --> 1921662 Genome Browser | |
Strand: | forward | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
51.81 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0006106 | |
ECHOBASE: |
EB3777 | |
ECOLIHUB: |
rsmF | |
OU-MICROARRAY: |
b1835 | |
STRING: |
511145.b1835 | |
COLOMBOS: | rsmF |
Product | ![]() ![]() |
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Name: | 16S rRNA m5C1407 methyltransferase | |||||||||||||||
Synonym(s): | RsmF, YebU, ribosomal RNA small subunit methyltransferase F | |||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | |||||||||||||||
Cellular location: | cytosol | |||||||||||||||
Molecular weight: | 53.228 | |||||||||||||||
Isoelectric point: | 5.359 | |||||||||||||||
Motif(s): | ||||||||||||||||
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Classification: |
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Note(s): | Note(s): ...[more]. | |||||||||||||||
External database links: | ||||||||||||||||
ECOCYC: |
G7008-MONOMER | |||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b1835 | |||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR023545 | |||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR001678 | |||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR011023 | |||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR018314 | |||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR023267 | |||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR029063 | |||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR031341 | |||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR027391 | |||||||||||||||
MODBASE: |
P76273 | |||||||||||||||
PDB: |
2FRX | |||||||||||||||
PFAM: |
PF17125 | |||||||||||||||
PFAM: |
PF13636 | |||||||||||||||
PFAM: |
PF01189 | |||||||||||||||
PRIDE: |
P76273 | |||||||||||||||
PRINTS: |
PR02008 | |||||||||||||||
PRODB: |
PRO_000023886 | |||||||||||||||
PROSITE: |
PS01153 | |||||||||||||||
PROSITE: |
PS51686 | |||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_416349 | |||||||||||||||
SMR: |
P76273 | |||||||||||||||
UNIPROT: |
P76273 | |||||||||||||||
Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
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Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
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promoter | TSS_2182 | 1918414 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [1] | ||
promoter | TSS_2183 | 1920196 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [1] | ||
promoter | yebVp2 | 1921715 | forward | nd | [ICWHO] | [2] | ||
promoter | yebVp6 | 1921725 | forward | nd | [ICWHO] | [2] | ||
promoter | yebVp1 | 1921745 | forward | nd | [ICWHO] | [2] | ||
promoter | yebVp5 | 1921753 | forward | nd | [ICWHO] | [2] | ||
promoter | yebWp3 | 1921957 | forward | nd | [ICWHO] | [2] |
Reference(s) |
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