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Gene | ![]() ![]() |
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Name: | ldtA ![]() |
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Synonym(s): | ECK1985, G7073, b1990, erfK, yeeG, yzzT | |
Genome position(nucleotides): | 2062391 <-- 2063323 | |
Strand: | reverse | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
49.62 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0006607 | |
ECHOBASE: |
EB2546 | |
ECOLIHUB: |
erfK | |
OU-MICROARRAY: |
b1990 | |
STRING: |
511145.b1990 | |
COLOMBOS: | ldtA |
Product | ![]() ![]() |
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Name: | L,D-transpeptidase LdtA | ||||||||||||||||||||||||
Synonym(s): | ErfK, LdtA, YeeG, YzzT | ||||||||||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||||||||||
Cellular location: | periplasmic space | ||||||||||||||||||||||||
Molecular weight: | 34.411 | ||||||||||||||||||||||||
Isoelectric point: | 8.931 | ||||||||||||||||||||||||
Motif(s): |
![]() |
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Classification: |
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Note(s): | Note(s): ...[more]. | ||||||||||||||||||||||||
Reference(s): | [1] Kuru E., et al., 2019 | ||||||||||||||||||||||||
External database links: | |||||||||||||||||||||||||
ALPHAFOLD: |
P39176 | ||||||||||||||||||||||||
DIP: |
DIP-9522N | ||||||||||||||||||||||||
ECOCYC: |
G7073-MONOMER | ||||||||||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b1990 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR038063 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR041597 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR005490 | ||||||||||||||||||||||||
PFAM: |
PF17969 | ||||||||||||||||||||||||
PFAM: |
PF03734 | ||||||||||||||||||||||||
PRIDE: |
P39176 | ||||||||||||||||||||||||
PRODB: |
PRO_000022531 | ||||||||||||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_416494 | ||||||||||||||||||||||||
SMR: |
P39176 | ||||||||||||||||||||||||
UNIPROT: |
P39176 | ||||||||||||||||||||||||
RNA cis-regulatory element | ![]() |
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Attenuation: | Translational |
Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
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Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
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promoter | TSS_2300 | 2062260 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [2] | ||
promoter | TSS_2301 | 2062756 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [2] | ||
promoter | TSS_2302 (cluster) | 2062780 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [2] | ||
promoter | TSS_2303 | 2063353 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [2] | ||
promoter | erfKp4 | 2063354 | reverse | nd | [COMP-AINF] | [3] |
Reference(s) |
![]() |
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