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Gene | ![]() ![]() |
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Name: | ygbI ![]() |
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Synonym(s): | ECK2730, G7416, b2735 | |
Genome position(nucleotides): | 2860467 <-- 2861234 | |
Strand: | reverse | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
51.56 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0008982 | |
ECHOBASE: |
EB2906 | |
ECOLIHUB: |
ygbI | |
OU-MICROARRAY: |
b2735 | |
STRING: |
511145.b2735 | |
COLOMBOS: | ygbI |
Product | ![]() ![]() |
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Name: | DNA-binding transcriptional repressor YgbI | ||||||||||||||||||||
Synonym(s): | YgbI | ||||||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||||||
Cellular location: | cytosol | ||||||||||||||||||||
Molecular weight: | 27.435 | ||||||||||||||||||||
Isoelectric point: | 6.781 | ||||||||||||||||||||
Motif(s): | |||||||||||||||||||||
|
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Classification: |
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Note(s): | Note(s): ...[more]. | ||||||||||||||||||||
Evidence: | [COMP-HINF-FN-FROM-SEQ] Human inference of function from sequence | ||||||||||||||||||||
Reference(s): |
[1] Perez-Rueda E., et al., 2000 [2] Perez-Rueda E., et al., 2004 |
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External database links: | |||||||||||||||||||||
ALPHAFOLD: |
P52598 | ||||||||||||||||||||
DIP: |
DIP-12110N | ||||||||||||||||||||
ECOCYC: |
G7416-MONOMER | ||||||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b2735 | ||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR036390 | ||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR037171 | ||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR036388 | ||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR018356 | ||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR014036 | ||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR001034 | ||||||||||||||||||||
MODBASE: |
P52598 | ||||||||||||||||||||
PFAM: |
PF08220 | ||||||||||||||||||||
PFAM: |
PF00455 | ||||||||||||||||||||
PRIDE: |
P52598 | ||||||||||||||||||||
PRINTS: |
PR00037 | ||||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS51000 | ||||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS00894 | ||||||||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_417215 | ||||||||||||||||||||
SMART: |
SM00420 | ||||||||||||||||||||
UNIPROT: |
P52598 | ||||||||||||||||||||
Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
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Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
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promoter | TSS_3025 | 2861256 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [3] | ||
promoter | ygbIp6 | 2861362 | reverse | nd | [COMP-AINF] | [4] | ||
promoter | ygbIp5 | 2861441 | reverse | nd | [COMP-AINF] | [4] |
Reference(s) |
![]() |
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