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Gene | ![]() ![]() |
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Name: | casE ![]() |
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Synonym(s): | ECK2751, G7426, b2756, cas6e, cse3, ygcH | |
Genome position(nucleotides): | 2879788 <-- 2880387 | |
Strand: | reverse | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
45.33 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0009042 | |
ECHOBASE: |
EB2916 | |
ECOLIHUB: |
casE | |
OU-MICROARRAY: |
b2756 | |
STRING: |
511145.b2756 | |
COLOMBOS: | casE |
Product | ![]() ![]() |
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Name: | pre-CRISPR RNA endonuclease | ||||||||||||||||
Synonym(s): | Cas6e, CasE, YgcH, crRNA endonuclease | ||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||
Molecular weight: | 22.293 | ||||||||||||||||
Isoelectric point: | 10.087 | ||||||||||||||||
Motif(s): | |||||||||||||||||
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Classification: |
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Note(s): | Note(s): ...[more]. | ||||||||||||||||
Reference(s): |
[1] Datsenko KA., et al., 2012 [2] Semenova E., et al., 2015 [3] van Duijn E., et al., 2012 |
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External database links: | |||||||||||||||||
ALPHAFOLD: |
Q46897 | ||||||||||||||||
DIP: |
DIP-12124N | ||||||||||||||||
ECOCYC: |
G7426-MONOMER | ||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b2756 | ||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR010179 | ||||||||||||||||
PDB: |
5H9F | ||||||||||||||||
PDB: |
5H9E | ||||||||||||||||
PDB: |
5CD4 | ||||||||||||||||
PDB: |
4U7U | ||||||||||||||||
PDB: |
4TVX | ||||||||||||||||
PDB: |
4DZD | ||||||||||||||||
PDB: |
4QYZ | ||||||||||||||||
PFAM: |
PF08798 | ||||||||||||||||
PRIDE: |
Q46897 | ||||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_417236 | ||||||||||||||||
SMART: |
SM01101 | ||||||||||||||||
SMR: |
Q46897 | ||||||||||||||||
UNIPROT: |
Q46897 | ||||||||||||||||
Transcriptional Regulation | ![]() ![]() |
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Display Regulation | |
Activated by: | SlyA, LeuO, StpA |
Repressed by: | CRP, H-NS |
Reference(s) |
![]() |
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